Denovo的微信推文已經陪伴大家走過了7期的內容,想必大家已經被Denovo強大的流式數據分析功能徹底圈粉了吧!前面7期的內容主要介紹了Denovo軟件的安裝,流式數據分析的入門篇,流式數據的批量處理,多色分析及流式凋亡數據分析。那么本期內容更厲害了呢!在本期內容中小達君將給大家奉上細胞周期的流式數據分析的相關內容。趕快打開電腦,搬好小板凳,和小達君一起開始實戰演習吧~
? 演示工具:裝有Denovo FCS Express 6的電腦一臺(參考入門篇的試用裝版本安裝~)
? 演示數據:細胞周期的流式數據分析
? 演示內容:細胞周期數據的分析,關于細胞周期各個參數的調用,統計學圖表的建立
1.添加實驗數據
參考前面推文可知,在Denovo軟件中添加數據的方式有多種,以下通過Data list命令按鈕直接添加,具體操作如下:
2.數據分析
將數據添加進來之后,圈門,把目的細胞拖拽出來,單獨分析,首先需要去除粘連細胞,不同的流式細胞儀排除粘連細胞時,用到的參數有時候不一樣,此處,通過改變PI通道的參數(分別改成FL2-A及FL2-W)來去除粘連細胞,具體操作如下圖:
3.細胞周期的流式數據分析模板建立
a.粘連細胞去除之后,可直接調用Denovo自帶的細胞周期分析模板,完成數據分析,具體操作如下:
b.將細胞周期分析的模板調出來之后,點擊OK,會彈出如下圖所示的界面,然后可以利用insert按鈕,插入文本框,從而可實現圖注的編輯,如下圖所示(我們可以對圖中的每個峰進行命名,從而可以對細胞周期中的各個時期進行命名和解釋):
4.細胞周期的流式數據分析中相關參數的調用
a.在細胞周期分析的模板中,有不同的模板可以調用,用戶可以根據自己的需要,選擇相應的細胞周期數據分析模型,具體操作如下圖所示:
b.不同的細胞周期數據分析模型,其分析標準不一樣,Denovo對不同的模型均作了相關的定義,用戶可以直接查看,具體操作如下:
c.當完成細胞周期數據分析后,接上面一步,可以通過Statistics按鈕,將相關的參數調出來,具體展示如下:
5.利用Spreadsheets插入圖表
(參考Part7的微信推文,里面有詳細的關于Spreadsheets的使用)
a.舉例,對細胞周期中G1期,S期及G2期各細胞比列的情況分析并做成柱形圖及餅狀圖,直接插入Spreadsheets,然后將相應的數據拖拽入表格中,點擊insert命令按鈕,插入相應的柱形圖和餅狀圖,操作如下:
b.同時通過Format按鈕可以更改圖形的相關參數,可以使圖表的排版及色彩布置達到令用戶滿意的效果,如下圖所示:(具體操作可參見part7-凋亡數據分析的中關于插入圖表的介紹)
由于微信的演示空間有限,本期的內容介紹就到此結束,Denovo FCS Express 6還有更多,更好,更強的流式數據分析功能,我們期待和您共同探討,感興趣的可以在下方留言并留下您的聯系方式,我們技術部的同事會和您聯系~