一個好的噬菌體抗體庫需要具備較大的容量和良好的多樣性,如果庫容量較小,則難以獲得高親和力的抗體。那么想要獲得較大庫容和多樣性豐富的噬菌體文庫,有哪些可以優化的因素呢?
一、選擇高轉化效率的大腸桿菌(感受態細胞)
噬菌體文庫的庫容會受大腸桿菌轉化效率的限制,選擇高效率的電轉感受態細胞,能有效的增加噬菌體文庫的庫容,另外也可以通過增加轉化次數來累積庫容。在噬菌體展示文庫構建過程中,使用比較多的感受態細胞有TG1、XL1-Blue、SS320等。
在進行轉化實驗時,要想獲得高的轉化效率,質粒/連接產物的純度、電轉的條件、質粒/連接產物的加入量以及操作的規范性也是需要注意的地方。
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達科為生物代理的LGC(Lucigen)提供轉化效率≧4×1010 cfu/μg的噬菌體文庫構建感受態細胞~
申請方式
1、關注“分子技術達論”微信公眾號,回復“感受態細胞”2、填寫相關信息,審核通過即可免費獲得試用裝!(每個用戶僅限申請一次,已購買過該產品的用戶不參與此次活動)
試用產品信息
高效噬菌體文庫構建感受態——Phage Display ElectroCompetent Cells
試用裝包含3種電轉感受態細胞【TG1, SS320 (MC1061 F'), ER2738】,每種感受態各4個反應;
1、抗體或多肽噬菌體展示庫構建的最佳選擇;
2、最高轉化效率的TG1感受態細胞,轉化效率≧4×1010 cfu/μg;
3、具有琥珀和非琥珀抑制基因的靈活性選擇;
4、生成更大的基因文庫,加速研究發現。
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二、輔助噬菌體投入量的優化及改造
噬菌體擴增的最終目的是將噬菌粒中單一拷貝的抗體片段基因通過噬菌體的擴增過程變成10-100個拷貝。不同文庫大小的噬菌體庫在擴增過程中需要的擴增體積是不一樣的,要想獲得大庫容的噬菌體文庫,以下條件需要提前進行計算評估。
1、擴增過程中含有噬菌粒的大腸桿菌的數目和體積;
2、對應加入多少輔助噬菌體進行有效感染(一般輔助噬菌體和TG1的比值MOI在10-20:1時能保證所有的TG1被感染上);
3、擴增后加入多少含有噬菌粒的噬菌體進行淘選(如果輔助噬菌體的展示效率只有10%,那最后要保證噬菌體抗體庫中每個抗體有10-100個抗體拷貝數的話,輔助噬菌體的投入量就應該是文庫大小的100-1000倍)
注:輔助噬菌體在TG1處于對數生長期時有比較好的感染效率,TG1處于對數生長期的OD600值在0.4-0.8。(1OD代表的菌濃度為1×109個/ml)。
另外,我們也可以選擇展示效率較高的輔助噬菌體,比如gIII基因缺失的Hyperphage(Progen, cat#PRHYPE),它能使得抗體或多肽在噬菌體展示的拷貝數增多(up to 5 vs. 0.01) ,從而提高淘選的效率。
三、采用體內重組技術進一步增加噬菌體文庫的庫容和多樣性
Cre-loxp體內重組系統可以有效增大抗體庫的庫容性,并且在對文庫進行的每一輪篩選中,所有的抗體都可以再次進行重組,保證了抗體庫的多樣性,因此該技術也為高容量抗體庫的發展提供了有利的工具。近期,YUAN DONG[1]等利用CreLoxP重組技術構建了人源的scFv噬菌體文庫,并對antiPCSK9抗體進行了篩選。
參考文獻
[1] YUAN DONG, FANWEI MENG,et.al. Construction and application of a human scFv phage display library based on CreLoxP recombination for antiPCSK9 antibody selection. INTERNATIONAL JOURNAL OF MOlecular medicine 47: 708-718, 2021.
Lucigen(美國)公司成立于1998年,提供各類用于分子生物學研究相關產品,可以使研究者成功克隆較難克隆的基因。2017年Lucigen成為Epicentre Technologies基因組試劑盒、酶和輔助試劑的獨家經銷商。2018年該公司被英國LGC收購,統一改名為Biosearch Technologies。目前產品線主要包括:體外轉錄、基因克隆(BAC克隆試劑盒)、感受態細胞(TG1噬菌體文庫構建感受態)、體外擴增、轉座子突變、蛋白表達、核酸提取、BHQ?探針、Stellaris?RNA FISH等。