重亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化是研究DNA甲基化的金標方法。該技術(shù)基于非甲基化胞嘧啶(C)向尿嘧啶(U)的化學(xué)轉(zhuǎn)化,即用重亞硫酸鹽處理基因組DNA,非甲基化胞嘧啶被轉(zhuǎn)化為尿嘧啶,而甲基化胞嘧啶不發(fā)生這種轉(zhuǎn)化,從而能夠在單核苷酸水平上確定DNA甲基化(圖1)。轉(zhuǎn)化后的序列可以進行多種分析,包括重亞硫酸鹽測序、焦磷酸測序、甲基化特異性PCR、高分辨率熔解曲線分析、基于微陣列的方法和下一代測序。
圖1 DNA重亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化概述
Diagenode根據(jù)您希望獲得的覆蓋度,提供不同的解決方案。
Diagenode DNA甲基化解決方案
優(yōu)質(zhì)Bisulfite Kit
●特定區(qū)域研究甲基化的方法
●快速的DNA亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化 — 只需1小時完成實驗
●無中間步驟
●甲基化分析中更高的DNA轉(zhuǎn)化率
產(chǎn)品名稱 |
貨號 |
規(guī)格 |
Premium Bisulfite kit |
C02030030 |
50 rxns |
Auto Premium Bisulfite kit |
C02030031 |
40 rxns |
優(yōu)質(zhì)RRBS Kit (Reduced Representation Bisulfite Sequencing,簡化甲基化測序)
●覆蓋范圍廣 – 4 million CpGs
●高通量 – 一次實驗可處理96個樣本
●高性價比 – 每條lane可以同時測序多達6個樣本
●已驗證 – 石蠟包埋組織、腫瘤和low-input樣本
●完整試劑盒 – 亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化試劑, MspI酶, 包含barcodes的文庫制備試劑和spike-in對照
圖2 各廠家之間CpG覆蓋度的對比
產(chǎn)品名稱 |
貨號 |
規(guī)格 |
Premium RRBS Kit x24 |
C02030032 |
24 rxns |
Premium RRBS Kit x96 |
C02030033 |
96 rxns |
優(yōu)質(zhì) WGBS Kit (Whole Genome Bisulfite Sequencing,全基因組重亞硫酸鹽測序)
●全基因組DNA甲基化篩選 – 從全基因組中制備亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化的DNA文庫
●兼容ChIP-Bis-Seq – 將ChIP和DNA甲基化結(jié)合在一次實驗中
●完整試劑盒 – 亞硫酸氫鹽轉(zhuǎn)化試劑和文庫制備試劑
圖3 A: 使用Diagenode的iDeal ChIP-seq Kit對人細胞系Gm12878 H3K27me3標記的組蛋白進行染色質(zhì)免疫沉淀;B: 使用Premium WGBS Kit對ChIP’d DNA進一步處理并測序。
產(chǎn)品名稱 |
貨號 |
規(guī)格 |
Premium WGBS Kit |
C02030034 |
8 rxns |
Diagenode簡介
Diagenode公司2003年成立于比利時,是世界上生產(chǎn)表觀遺傳學(xué)產(chǎn)品的知名公司。表觀遺傳學(xué)及二代、三代測序樣本前處理專家,是表觀遺傳學(xué)、生物樣本制備和診斷的完整表觀遺傳學(xué)解決方案的領(lǐng)先供應(yīng)商。該公司提供創(chuàng)新的Biorutpor破碎以及IP-star自動化儀器、試劑盒和高品質(zhì)抗體,以簡化DNA甲基化、ChIP以及ChIP-Seq的工作流程。