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RNase R——RNase家族的“外貌協會成員”

作者:admin信息來源:達科為日期:2017年12月11日打印字體:  
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RNA酶,是一種將RNA水解成小分子核苷酸的核酸酶。可簡單分為外切核糖核酸酶和內切核糖核酸酶。其中外切酶包括PNPase,RNase PH,RNase Ⅱ,RNase R,RNase D,RNase T,Oligoribonuclease,Exoribonuclease I,Exoribonuclease Ⅱ 等;內切酶包括RNase A,RNase H,RNase I,RNaseⅢ,RNase L,RNase P,RNase PhyM,RNase T1,RNase T2,RNase U2,RNase V1,RNase V 等。

在成員眾多的RNase家族,就有這么一個“外貌協會”成員,它就是只針對線性RNA的RNase R。在介紹RNase R之前,先允許小達君給大家科普下環狀RNA~~

 


圖1. 線性RNA與環狀RNA


環狀RNA(Circular RNA,circRNA)是區別于線性RNA的一類新型環狀非編碼RNA,半衰期長,具有物種保守性和組織特異性。其獨特的環狀結構使其不容易被RNA酶降解,因此在細胞內穩定性很強,在新型生物標記、生物學機制研究等方向具有巨大的潛力和研究價值。

 


圖2. 環狀RNA的穩定性


“cicrRNA”這一概念較早出現在1971年,在RNA病毒中被發現,但長期以來,由于其表達豐度很低,所以一直被認為是轉錄的“噪音”,沒有實際作用。

 


圖3. 環狀RNA的miRNA海綿作用


直到2012年,Salzman的一篇環狀RNA文章為其正名,于是大量的研究者涌入這個領域,不斷產出環狀RNA的研究成果。目前研究較多的就是位于細胞質中的外顯子形成的環狀RNA,其含有大量miRNA結合位點,可起到miRNA海綿作用,結合并封閉miRNA的調控作用,從而使其靶基因表達增強。

 


圖4. RNase R分離套索RNA


隨著環狀RNA的深入研究,環狀RNA制備問題就越來越備受關注。Lucigen提供大腸桿菌來源的RNase R,是一種Mg依賴性的3’ →5’核糖核酸外切酶,能消化基本上所有線性RNA,但不消化套索或環狀RNA的結構,或者3’突出短于7個核苷酸的雙鏈RNA。即是除了tRNA,5S RNA和內含子套索結構外,大多數細胞RNA都將被RNase R完全消化。如圖4,RNase R可從總RNA中分離出內含子前體mRNA剪切產生的套索RNA。以這種方法獲得的RNA作為模板來生產標記的cDNA,可作為含有潛在的內含子序列的微陣列的目標,或者用于包含完整的染色體或者基因組的重疊區域平鋪陣列。產生的cDNA不代表線性內含子,但其含有的序列是來源于內含子的。

 

應用

1.選擇性剪切研究

2.基因表達研究

3.內含子cDNA制備

4.cDNA文庫內含子篩選

5.剪切中間體和套索RNA分離

 

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RNase R

RNR07250

250U

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Lucigen(epicentre)


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